我国冷链物流产业是在农业大国对农产品，例如果蔬、肉类、水产品等的运输和消费中应运而生的。我国是推进现代农业和农村建设的农业出口大国，也是农业消耗大国。虽然近年来我国农产品冷链发展比较快，但是与发达国家比起来，还存在着一些问题，具体突出表现在以下几点：
一、冷链物流基础设施能力严重不足。从硬件上来说，冷链设备装备不足、冷链运输装卸过程损耗大等是比较严重的问题；从软件上来说，冷链管理和运行技术落后、冷链厂商专业服务不足等都是迫切需要改善的。
二、鲜活农产品通过冷链流通的比例偏低。食品冷藏的运输率只有10%左右，而发达国家在80%以上。果树在运输以及储存等物流环节上损耗率达25%，而发达国家的果蔬损失率则在5%以下。同样是冷链物流行业的发展，却形成了如此鲜明的对比。
三、冷链物流的一些技术没有发展到位。各国冷链物流企业应依靠科技创新提升冷链物流业整体水平，技术创新体现在冷链物流的各个环节。并且使用先进的产地加工技术，提高产品质量、延长保鲜期。在储藏技术装备方面，积极采用自动化冷库技术，包括贮藏技术自动化、高密度动力存储（HDDS）电子数据交换及库房管理系统，其贮藏保鲜期比普通冷藏延长1～2倍。在信息技术方面，冷链物流要实施全程温度控制管理，必须依靠先进的信息技术作为支撑。
四、冷链企业发展比较滞后。正规的提供第三方冷链物流的物流公司规模大的不多，更多的是游击队围攻正规部队，一些第三方物流以价格来竞争，无利润来进行投资和扩大规模。在“量”就是王的物流运作中，如果没有足够的量，价格会居高不下，便会制止更多的潜在客户使用正规的服务。
五、冷链物流法规体系并不健全。我国的冷链物流产业没有形成全程的冷链体系，并且缺乏相应的法规标准。从中国物流与采购联合会了解到，一直以来，政府部门更多的关注冷链物流以外的产品产地以及卫生问题，但在物流方面缺乏一定的执行力。
现代化冷链物流的要点就是“资源与体系的完善整合”，现代化农业冷链物流是一项新兴的复合性产业，涉及运输、仓储、货代、联运、流通加工、交易、信息、检测、保鲜、包装等行业，其运作和物流受理，关联很多经济领域、经济部门、经济地域与行政区域。
在“十二五”规划中，农业更是重中之重。可以说，“十二五”规划为冷链物流带来了巨大的发展契机。我国冷链物流产业面临着严重的挑战，有挑战就会有动力。冷链的特点是“冷”，而灵魂在于“链”。掌握信息化，完善冷链体系建设，中国冷链物流行业发展之路还将比较坎坷。
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